Непонятное количество точек - тоже не предложение было, а просто точки. В смысле, это же просто длинная пауза, я вообще не ожидал, что вы их трогаете.
А "?!!" было по аналогии с "?.." На этот счёт строгих правил русского языка, кажется, нет. Поэтому я просто поменял знаки местами с "!!?" на "?!!".

Кстати, у меня тут пара вопросов возникла, когда я смотрел на изменения на гитхабе.
-Бесполезно. Во всей этой области излучаются мощные помехи.
+Бесполезно. Здесь повсюду поставлены мощные помехи.

Да, с "во всей этой области" вышло не очень, но я думал, что там имелось в виду именно, что помехи излучаются. То есть помехи - сигналы, которые излучаются, а не установки, которые их излучают.

-Но никто не нападает на нас
-Может, все ушли?
-Всё-таки, я могла бы просто взять их под контроль (мш)

+Но никто не пытается напасть.
+Видимо, все уже ушли.
+Не считая тех, кого я контролирую. (мш)

Вот тут точно не так. Мисаки говорит "Может все ушли?", подразумевая, что они ушли, чтобы она не взяла их под контроль. И тогда следующая реплика тоже меняется (но всё равно, ближе к отредактированному варианту. У  меня там вообще было всё очень плохо, но я не мог ничего лучше придумать)

Ну и ещё мелкие вопросы типа "усилитель усиливает", но там, наверное, так даже лучше.